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与此同时，钱军本人也先后获得国家自然科学基金、省临床医学科技专项、省自然科学基金等各级课题资助20余项；获教育部科技进步二等奖、省科技进步三等奖和厅市级科技成果奖20余项；发表论文近200篇，其中SCI论文90余篇，受到国际同行关注和认可，多次参加在美国、澳大利亚等海外地举行的国际会议发言并获奖。
比起身体上的病痛，血液病患者心理上的痛苦也急需关注。钱军说，他在临床上常常碰到一些家属对患者隐瞒病情，非但没有带来好的效果，反而让患者更加痛苦。“有一些患者通过治疗本可以很大的提高生存质量，但他们往往被自己的内心世界给打败了。”钱军表示，今后，他将带领团队更多地探索血液病患者的心理健康，进行有针对性的心理会诊，给他们的内心带去更多阳光。
