芥菜是我国重要的经济作物,用作油料、蔬菜和调味品。然而,学界对芥菜的起源和多样性中心的结论不完全一致,芥菜的地理起源一直是未解之谜。
记者15日从湖南农业大学获悉,在国家自然科学基金等项目资助下,湖南农业大学刘忠松教授团队联合中国农业科学院油料作物研究所华玮研究员团队等国内外多家单位,在芥菜起源和驯化研究方面取得重要进展。相关研究成果以《芥菜起源、驯化和多样性的基因组学解析》为题发表在《自然-遗传学》上,揭示了芥菜多样性变异的遗传基础,为芥菜种质资源利用和基因组选择育种奠定了基础。
据介绍,研究首先组装出我国特有的油用黄籽芥菜地方品种的染色体级别全基因组序列。为了进一步阐明芥菜的遗传变异,作者对全球480份芥菜种质进行了基因组重测序,通过系统进化、群体结构和主成分分析将其分为三大类六个遗传类群,通过核、质基因组进化分析、种群动态分析等重建了芥菜的起源和驯化历史,发现芥菜于8000-14000年前起源于西亚地区,由西向东沿三条独立路径传播。
团队通过基因组选择分析、全基因组关联分析和基因表达验证,揭示了芥菜传播过程中,在开花期上对环境的适应以及人工选择籽用、茎用和根用芥菜形态变异的基因组区域,并鉴定和克隆出相关调控基因。
刘忠松教授介绍,高质量黄籽芥菜参考基因组和重测序鉴定的不同类型芥菜的基因组变异,为芥菜基因组学研究建立了平台,为寻找新的基因提供了线索。鉴定出的新基因、单倍型为不同用途芥菜的基因组选择育种提供了基因资源和科学依据,将有助于提高育种效率、加速芥菜育种进程。据新华社